Analiza białek 1200-Bt11AB-SD
Wykład (WYK)
Semestr zimowy 2020/21
Informacje o zajęciach (wspólne dla wszystkich grup)
| Liczba godzin: | 30 | ||
| Limit miejsc: | (brak limitu) | ||
| Zaliczenie: | Egzamin | ||
| Rygory zaliczenia zajęć: | egzamin |
||
| Literatura uzupelniająca: | http://www.piercenet.com/ http://www.enzim.hu/~szia/cddemo/edemo0.htm http://www.youtube.com/watch?v=J-wao0O0_qM http://www.uniprot.org Protein Data Bank (PDB) Cambridge Structural Database (CSD) Inorganic Crystal Structure Database (ICSD) Biological Macromolecule Crystallization Database (BMCD) UniProt Nuc P., Nuc K. (2006) Produkcja białek rekombinowanych. Post. Bioch. 52, 448. Śliwinska M, Robaszkiewicz K, Czajkowska M, Zheng W, Moraczewska J. (2018) Functional effects of substitutions I92T and V95A in actin-binding period 3 of tropomyosin. Biochim Biophys Acta Proteins Proteom. 2018 Apr;1866(4):558-568 |
||
| Metody dydaktyczne: | wykład kursowy |
||
| Metody dydaktyczne - inne: | Prezentacja multimedialna, dyskusja, zajęcia w trybie zdalnym z wykorzystaniem narzędzi MS Teams |
||
| Literatura: |
1. Ćwiczenia z biochemii, Kłyszejko-Stefanowicz (red.), wyd. 1, 2005, PWN Warszawa. 2. Biochemia, Berg, Tymoczko, Stryer , wyd 4 zm., 2009, PWN Warszawa. 3. Principles and techniques in biochemistry and molecular biology, Wilson K. Walker J., ed., Oxford University Press, 2005. 4. Crowley T.E., Kyte J. Experiments in the purification and characterization of enzymes. A laboratory manual. Academic Press, Elsevier, 2014. (podręcznik dostępny w ZBiBK) |
||
| Efekty uczenia się: |
W01 - student potrafi zidentyfikować i opisać omawiane grupy białek W02 - ma wiedzę w zakresie zasad planowania badań z wykorzystaniem metod i narzędzi badawczych stosowanych w badaniach białek W03 – ma wiedzę na temat wykorzystania białek w biotechnologii K01 - Student jest świadom dynamicznego rozwoju nauki w dziedzinie analizy białek i rozumie potrzebę aktualizacji wiedzy na podstawie najnowszej literatury |
||
| Metody i kryteria oceniania: |
Egzamin pisemny (uzyskanie punktów w ilości 0-50% - ocena niedostateczna; 51-60% - ocena dostateczna; 61-70% - ocena dostateczna plus; 71-80%- ocena dobra; 81-90% - ocena dobra plus: 91-100% - ocena bardzo dobra) |
||
| Zakres tematów: |
1. Metody izolacji struktur komórkowych: frakcjonowanie komórki, izolowanie organelli i podstruktur komórkowych, identyfikacja struktur komórkowych; 2. Metody uwalniania białek z komórek zwierzęcych i roślinnych: metody enzymatyczne, fizyczne i chemiczne; 3. Oczyszczanie białek z lizatów komórkowych: metody chromatograficzne, wysalanie, ultrawirowanie; 4. Elektroforetyczne metody analizy białek: elektroforeza denaturująca, elektroforeza natywna, Western-blot, Far Western blot; 5. Analizy sekwencji i masy cząsteczkowej: sekwencjonowanie polipeptydów, porównywanie sekwencji, wirowanie analityczne, spektrometria mas; 6. Analizy struktury drugorzędowej: dichroizm kołowy, kalorymetria różnicowa, ograniczona proteoliza; 7. Analizy struktury trzeciorzędowej: rentgenografia strukturalna, NMR; 8. Nowoczesne metody dynamicznego badania białek w komórce: śledzenie lokalizacji i przemieszczania białka w komórce; identyfikacja partnerów oddziałujących z białkiem; 9. Elementy proteomiki: metoda „pull out”, elektroforeza dwukierunkowa, identyfikacja cząsteczek metodą trypsynolizy i spektrometrii mas; 10. Podstawy produkcji białek rekombinowanych; 11. Analiza białek w biotechnologii – markery i enzymy. |
||
Grupy zajęciowe
| Grupa | Termin(y) | Prowadzący |
Miejsca  |
Akcje |
|---|---|---|---|---|
| 1 |
każdy czwartek, 9:15 - 10:45,
(sala nieznana)
jednokrotnie, piątek (konkretny dzień, zobacz opis przedmiotu), 9:15 - 10:45, (sala nieznana) |
Małgorzata Śliwinska | 13/13 |
szczegóły |
|
Wszystkie zajęcia odbywają się w budynku: |
||||
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Kazimierza Wielkiego w Bydgoszczy.